2007年開始，教會重新作了一次整合，定位台北靈糧堂為「使徒性門徒小組教會」，並按照聖經所訂下的原則，以五重職事的功能和運作來「成全聖徒，各盡其職，建立基督的身體」。在整合期中，區永亮牧師扮演十分關鍵的角色。他自1997年加入台北靈糧堂後，曾擔任過國度事奉中心負責人、牧養處處長、事工管理處處長及執行牧師等職務。上帝使用過去管理過大型工廠的他，幫助台北靈糧堂的組織架構更趨完整，使教會的治理運作更加有次序。

為了要落實「各盡其職」，弟兄姊妹需要得到造就及提升，不只提升，教會更要為不同背景、不同職場的弟兄姊妹預備不同的事奉平台，並且鼓勵、教導信徒們在職場上運用神所賜的恩膏，發揮其應有的轉化能力。基於以上這些考量，台北靈糧堂發展出福音中心的策略，讓台北母堂成為一個基地，在台北十二個行政區，按照需要建立地區型福音中心。福音中心策略，也跟基層事工結合，讓教會的弱勢關懷服務更深入社區。這十幾年來，福音中心策略確實達到預期的果效，更多弟兄姊妹有服事跟操練的機會，教會進而發揮轉化社會的角色。

引進職場動力，更新教會引擎

2011年7月，台北靈糧堂進入新的里程碑，周神助牧師卸下主任牧師，轉任靈糧全球使徒性網絡主席，由區牧師承接牧養靈糧堂的棒子。區牧師曾開玩笑地說：「主任牧師這份工作，對我來說真的是太難了！如果我知道來台北靈糧堂會有這一天，我就應該改名叫『區神助』才對。」但區牧師卻很清楚他的目標和異象，他花功夫調整教會的組織架構、成全弟兄姊妹，讓一些對於教會事工有強烈負擔的專業人才進到教會，用他們的恩賜、專業和教會同工一起配搭。為了達成這個目標，教會成立了主任牧師辦公室，邀請了朱黃傑執事擔任主任，後來朱黃傑執事邀請了呂健萍處長等人陸陸續續進到教會，他們都是非常卓越、有經驗的職場人士，因著他們的加入，台北靈糧堂在教會治理上進到新的一頁。

自2014年開始，教會開始不斷進行軟硬體的更新，其中最浩大的工程之一，就是建置教會內部的「企業資源管理系統」 (Enterprise Resource Planning，簡稱ERP)。讓母堂或福音中心同工的加班休假、簽呈、請購採購、以及各項人事或服務性的表單，都可以透過電子流程進行簽核。這是教會治理與系統連結的重大突破，也是資訊發展重要的里程碑，一步一步將台北靈糧堂的資訊基礎建設向職場標準推進。同時，教會也更加強調規章辦法的落實，事工管理處呂健萍處長表示：「教會這麼大，當規章辦法訂定出來之後，要落實是非常困難的，但因為區牧師總是力挺、力推，才讓教會的架構跟系統可以完整被落實。」這些繁複的行政作業，看似與教會的使命沒有直接相關，卻可以幫助教會更能夠有效地使用有限的資源，發揮更大的果效來建造神的家！

資源共享，用合一帶下神國

   區牧師在接任主任牧師的第一年，就訂下了三大目標：弱勢／職場轉化、家庭事工、宣教植堂。2015年，進而衍生出台北靈糧堂三大目標和策略：「轉化是我們的責任、家庭是我們的見證、宣教是我們的使命。」依循這三大策略，台北靈糧堂的事工得以更加聚焦，特別在宣教的使命上，在區牧師的帶領下有了突破性的進展，除了同文化、近文化的宣教，更加著重跨文化的宣教。特別是2017年起組成了來自不同分堂跨牧區、跨年齡層的短宣Super Team，結合了職場弟兄姊妹的專業，讓短宣的內容更多元，不只帶給當地屬靈的祝福，更帶給他們實質生活上的幫助。

永續經營的傳承使命一直都在區牧師的心裡，他在台北靈糧堂樹立了一個非常好的榜樣和見證：從七十歲以後，由全職主任牧師改為約聘，每兩年一簽。當台北靈糧堂的整體事工已經發展到一個程度，不再是一個人可以完全獨當，2017年10月區牧師做了一個清楚的決定：建立一個治理團隊來共同分工。並經聖工聯席會通過，於11月成立「主任牧師治理小組」。

區牧師從台北靈糧堂本身現有的同工當中，邀請了朱黃傑執事、林德安牧師與周巽正牧師，成為治理小組成員。而他為此事禱告時，神很清楚地把這三個人放在他的心中，雖然黃傑執事並非傳道人，但專長是治理，具有執行力；德安牧師是在牧養；巽正牧師則是很有idea(創意)、幹勁十足，且善於協調與連結，三人恩賜雖不同，執行的責任不同，但能以不同的方式來服事，最終一起帶出共同的目標和結果。合一是「才幹+異象+同心」，是心靈的合一，區牧師相信這會發揮一個更大的治理力量。

根基不變，以禱告出發

 建立教會，最重要的根基還是禱告。2012年7月迄今，區牧師忠心守禱告殿的6-8班，遇到年節、颱風天也未曾中斷；2017年起，更多次持續邀請烏干達凱丹尼牧師(Dennis Kasirye)，來教導同工、弟兄姊妹禱告的重要性和急迫性，再次點燃台北靈糧堂禱告的火。事工的發展很重要，但區牧師更看重生命，他常說：「每個人的命定都是一樣的，就是要活出像基督的生命；但我們的呼召都不一樣，呼召是神要你去發揮影響力的地方。」低調的區牧師，向來做的比說的多，他在禱告中領受行動，在行動中持續禱告，以行動實踐他的信仰，是台北靈糧堂眾弟兄姊妹最好的榜樣，是許多人心目中最敬佩的「區爸」！