最後「尼希米」要處理的問題，就是他們與外邦人雜婚的問題，由《瑪拉基書》觀察，他們不但「娶事奉外邦神的女子為妻」，甚至有人休離前妻「使前妻嘆息哭泣的眼淚遮蓋耶和華的壇」。上帝言明「休妻的事和以強暴待妻的人都是我所恨惡的！」( 參瑪二 11-16) 一、猶大人娶外邦女子 「尼希米」看見百姓與周圍的各民族通婚「娶了亞實突、亞捫、摩押的女子為妻」。這樣的雜婚使得他們的民族漸漸被清洗，因為「他們的兒女說話，一半是亞實突的話，不會說猶大的話，所說的是照著各族的方言」。下一代一旦失去本族的語言能力，生活方式就會與外邦混雜，最終整個民族消失。 二、叫他們起誓不再與外邦婚娶 在「以斯拉」的時代，已經處理過一次雜婚，「尼希米」建城之後，帶領他們重新立約，也處理過一次他們與外邦人混雜的問題(參十章)。因此「尼希米」極其憤怒，懲處違約者「斥責他們，咒詛他們，打了他們幾個人，拔下他們的頭髮」，並且要求他們「指著神起誓，必不將自己的女兒嫁給外邦人的兒子，也不為自己和兒子娶他們的女兒。」「尼希米」也重申以色列國的衰亡，始於所羅門當年「在這樣的事上犯罪麼？在多國中並沒有一王像他，且蒙他神所愛，神立他作以色列全國的王；然而連他也被外邦女子引誘犯罪。」與外邦通婚的問題，在於開了一條拜外邦神的門戶，這就是所羅門最大的敗筆。 雖然新約時代，我們看到以色列人的民族優越感是不可取的，現今也不以種族主義為合宜，但當時猶大人的確須保存純正的血統與信仰。純正的血統是預備彌賽亞的降生，純正的信仰是保持上帝的啟示得以向世人準確地傳揚。 三、潔淨祭司的婚姻 在雜婚之中，也有祭司在列「大祭司以利亞實的孫子、耶何耶大的一個兒子是和倫人參巴拉的女婿」。「和倫人參巴拉」也是當時擾亂他們建城的外邦領袖之一。「尼希米」將這位祭司除名，因為「他們玷污了祭司的職任，違背你與祭司利未人所立的約」。 「尼希米」不但「潔淨他們，使他們離絕一切外邦人」，也重新「派定祭司和利未人的班次，使他們各盡其職」。也要求「百姓按定期獻柴和初熟的土產」。 「尼希米」所作的每一項改革，都不容易，他除了完成一個行政長官的職責，他也協助祭司系統的重建。他所遇到的阻力，從頭至今都很艱難，因此他三番五次的禱告「我的神啊，求你記念我，施恩與我」。