會友上百人、聚會場地卻只有一層樓的澎湖靈糧福音中心，未來新堂位於澎湖馬公市中衛段，距離舊址約十分鐘車程。2023年年初開工，預計2024年年底完工、2025年六月底裝潢完成。未來的新會堂建在斜坡上，一樓是辦公活動區域，二、三樓是主會堂，四樓是接待牧者與短宣隊的休息處。

四百多年前，就有荷蘭宣教士到澎湖傳福音，1997年起，台北靈糧堂持續差派短宣隊伍，包括梅許以謹牧師（梅媽媽）、謝明宏牧師、胡毅牧師、許靚慈牧師、廖承增牧師、馮仁棣牧師等人，每年帶領短宣隊到訪澎湖，十多年從不間斷。及至2011年區牧長退休會來到澎湖，當時的主任牧師區永亮看到遍地都是廟宇，就決定在澎湖成立台北靈糧堂第一個離島據點。

於是隔年，羅維正牧師跟陳東琳師母受母堂差派，回到家鄉澎湖成立教會。沒想到所租借的場地在教會人數增長下，隔年就不敷使用。2015年，神感動當時高齡86歲的台北靈糧堂香柏牧區許秀真女士，希望祝福父親的家鄉，陸續奉獻了超過一千萬。後續來自會友郭貞的大筆奉獻、以及東西中區弟兄姐妹的擺上，終於成就了建堂的曙光。2017年，教會與新堂預定地的地主簽約，預留了土地使用權。

在神的奇妙帶領下，2018年，神前後透過無償協助的代書、基督徒縣長陳光復，祝福教會在兩個半月就完成了興辦事業計畫，將農業用地改為宗教用地。特別的是，陳光復作為在位最久的澎湖縣縣長，在教會興辦事業計畫完成後的同年，選舉落敗、四年後才又重掌縣府。而教會也在他回任時正式動土，這讓台北靈糧堂執事會主席朱黃傑直呼，「我終於明白，為何要在陳光復縣長的任內完成，因為神要建造在祂兒女的當中，我們只是受呼召成為上帝的見證人！」。

羅維正牧師回憶，2021年教會成立建堂籌備委員會，在短短半年內、開了35次會議，過程相當不容易，特別是疫情中全台大缺工，外島澎湖更是長年缺工、缺料。但神最後卻奇妙預備了夏綠第營造有限公司，在2022年10月，談妥適合的工班與價錢簽約。

「我是耶和華，這是我的名。我必不將我的榮耀歸給假神，也不將我的稱讚歸給雕刻的偶像。看哪！先前的事已經成就，現在我將新事說明，這事未發以先，我就說給你們聽。航海的和海中所有的，海島和其上的居民，都當向耶和華唱新歌，從地極讚美他。」在感恩禮拜的尾聲，周巽正用以賽亞書第42章八到十節，宣告「澎湖」必不將榮耀歸給假神，也鼓勵弟兄姐妹，在接下來兩年的建殿旅程中，不只是看見外在建築的成形，更重要的是個人生命也更深降伏、被神來建造，活出神憐憫的心，「當2025年6月教會完成剪綵時，希望我們都成為神手中榮美的聖殿，來承接神榮耀的工作！」